Les intolérances les plus fréquentes chez les patients SII sont : l'intolérance au lactose, la malabsorption du fructose, l'intolérance aux fructanes (souvent confondue avec le gluten), l'intolérance aux polyols, l'intolérance à l'histamine et la sensibilité globale aux FODMAPs. Chaque intolérance a son mécanisme propre et son régime d'éviction spécifique.
Guide complet, diététicien diplome
Les 14 intolérances digestives a explorer quand on a un SII
Vous avez un Syndrome de l'Intestin Irritable diagnostique, ou des troubles digestifs chroniques inexpliques ? Ce guide recense les 14 principales intolérances et hypersensibilités alimentaires qui peuvent mimer ou coexister avec le SII. Pour chaque intolerance : mecanisme, symptomes, aliments a eviter, aliments toleres, et comment tester.
14 intolérances détaillées
Protocole en 4 étapes
Téléconsultation France entière
Carte d'orientation
Par où commencer ? Mon symptôme dominant
Identifiez votre symptôme le plus gênant et explorez les pistes correspondantes en priorité.
| Symptôme dominant | Intolérances à explorer en priorité |
|---|---|
| Ballonnements massifs | Fructanes n°03 • GOS n°05 • FODMAPs n°14 • SIBO n°09 |
| Diarrhée acide explosive | CSID n°07 • Polyols n°04 • Lactose n°01 |
| Migraines + digestif | Histamine n°06 • Amines n°11 • Salicylates n°10 • Additifs n°13 |
| Flatulences +++ | GOS n°05 • Fructanes n°03 • SIBO n°09 • Lactose n°01 |
| Diarrhée matinale après café | Caféine n°12 • Fructose n°02 • Lactose si lait le matin |
| Symptômes après blé | Fructanes n°03 en premier • Puis SGNC n°08 • Toujours exclure la maladie cœliaque |
| Urticaire + digestif | Histamine n°06 • Salicylates n°10 • Amines n°11 • Additifs n°13 |
| Gaz après légumineuses | GOS n°05 • FODMAPs n°14 |
| Constipation chronique | SIBO à méthane n°09 • Déshydratation • FODMAPs déséquilibrés |
| Diarrhée + fatigue + carences | SIBO n°09 • Maladie cœliaque (bilan médical urgent) • CSID n°07 |
| Flush cutané + digestif | Histamine n°06 • Amines n°11 • Salicylates n°10 |
Exploration détaillée
Les 14 intolérances en détail
Pour chaque intolérance : le mécanisme, les symptômes, les aliments à éviter, les aliments tolérés, et comment tester.
01
Intolérance au lactose
Mécanisme : Déficit en lactase → lactose non digéré fermente dans le côlon → gaz et effet osmotique.
Symptômes
- Ballonnements et crampes abdominales
- Diarrhée 30 min–2h après ingestion
- Borborygmes (bruits intestinaux)
- Nausées possibles
- Symptômes dose-dépendants
À éviter
- Lait de vache, chèvre, brebis
- Fromages frais : ricotta, mozzarella, cottage, fromage blanc
- Crèmes dessert, glaces, crème fraîche
- Yaourts (selon quantité)
- Produits avec « lait en poudre » ou « lactosérum »
Bien tolérés
- Fromages affinés : emmental, comté, parmesan, gruyère
- Beurre clarifié (ghee)
- Laits et produits « sans lactose »
- Laits végétaux (amande, avoine, riz, coco)
- Yaourts avec ferments actifs (mieux tolérés)
Comment tester : Test respiratoire H2 après charge de lactose 25g (prescrit par le médecin). Ou éviction 2 semaines puis réintroduction.
La tolérance est dose-dépendante. Peut être secondaire (post-gastro-entérite, maladie de Crohn, SII). Différent de l'allergie aux protéines du lait (IgE).
02
Malabsorption du fructose
Mécanisme : Absorption intestinale insuffisante du fructose libre (transporteur GLUT5 limité) → fermentation colique + effet osmotique.
Symptômes
- Diarrhée ou selles molles 1–3h après repas
- Ballonnements importants
- Douleurs abdominales
- Flatulences
- Fatigue post-prandiale
À éviter
- Pomme, poire, mangue, cerise, pastèque, figue
- Jus de fruits, smoothies
- Miel (riche en fructose)
- Sirop de glucose-fructose (HFCS)
- Fruits secs : dattes, figues, raisins secs
- Ketchup, sauces sucrées
Bien tolérés
- Banane mûre, agrumes, fraises, myrtilles, raisin (petites quantités)
- Légumes (peu de fructose libre)
- Glucose pur (dextrose) comme substitut
- Fruits consommés avec un repas et en petites quantités
Comment tester : Test respiratoire H2 après charge de fructose 25g. À distinguer impérativement de l'Intolérance Héréditaire au Fructose (HFI), maladie grave différente.
Le fructose en excès de glucose est mal absorbé. Les polyols (sorbitol) aggravent la malabsorption du fructose. Fréquemment associé au SII.
03
Intolérance aux fructanes
Mécanisme : Les fructanes (inuline, FOS) ne sont pas digérés par l'intestin humain → fermentation bactérienne rapide → distension et gaz.
Symptômes
- Ballonnements très importants (souvent le symptôme dominant)
- Flatulences excessives
- Douleurs abdominales crampeuses
- Alternance diarrhée/constipation
- Souvent confondu avec l'intolérance au gluten
À éviter
- Blé, seigle, orge et dérivés (le problème = fructanes, PAS le gluten)
- Oignon, échalote, ail (sources majeures)
- Poireau, artichaut, asperge
- Betterave, chicorée
- Suppléments prébiotiques (inuline, FOS)
Bien tolérés
- Riz, maïs, quinoa, sarrasin, millet
- Pain au levain longue fermentation
- Huile aromatisée à l'ail (les fructanes ne passent pas dans l'huile)
- Partie verte de l'oignon et du poireau
- Pomme de terre, carotte, courgette, poivron, tomate
Comment tester : Pas de test biologique standardisé. Protocole d'éviction FODMAPs 4–6 semaines avec diététicien, puis réintroduction ciblée des fructanes.
Les fructanes du blé expliquent souvent les symptômes des personnes se croyant intolérantes au gluten sans maladie cœliaque.
04
Intolérance aux polyols
Mécanisme : Les polyols (sorbitol, mannitol, xylitol, maltitol) sont peu absorbés → puissant effet osmotique + fermentation.
Symptômes
- Diarrhée souvent explosive et rapide
- Ballonnements
- Crampes abdominales
- Effet laxatif dès petites doses
À éviter
- Fruits : pomme, poire, abricot, pêche, prune, cerise
- Champignons, chou-fleur (mannitol)
- Chewing-gums et bonbons « sans sucre »
- Médicaments en sirop (vérifier excipients)
- Produits « light » ou « diabétiques »
Bien tolérés
- Banane, fraises, myrtilles, raisins, melon
- Courgette, haricot vert, carotte, épinard
- Sucre, glucose (pas des polyols)
- Pain, riz, pâtes classiques
Comment tester : Principalement diagnostic par éviction et réintroduction dans protocole FODMAPs.
Les produits « sans sucre » sont une cause fréquente et méconnue de diarrhées chroniques. Lisez les étiquettes : E420 (sorbitol), E421 (mannitol), E967 (xylitol).
05
Intolérance aux GOS (Galacto-oligosaccharides)
Mécanisme : Les GOS (raffinose, stachyose) ne peuvent pas être hydrolysés par l'intestin humain → fermentation par le microbiote → gaz abondants.
Symptômes
- Flatulences abondantes après légumineuses
- Ballonnements post-repas
- Crampes abdominales
- Diarrhée possible si grandes quantités
À éviter
- Légumineuses : lentilles, pois chiches, haricots secs, fèves
- Soja et dérivés : lait de soja, tofu, edamame
- Noix de cajou, pistaches (grandes quantités)
Bien tolérés
- Tempeh, tofu fermenté
- Haricots verts (très faibles en GOS)
- Pois chiches en boîte bien rincés
- Courgette, aubergine, tomate, carotte
Comment tester : Pas de test spécifique. Diagnostic par éviction et réintroduction dans le protocole FODMAPs.
Le trempage prolongé + rinçage des légumineuses réduit significativement les GOS. La fermentation (tempeh, miso) les dégrade aussi.
06
Intolérance à l'histamine
Mécanisme : Déficit en diamine oxydase (DAO) ou HNMT → incapacité à dégrader l'histamine alimentaire → accumulation → effets vasculaires, digestifs, neurologiques.
Symptômes
- Ballonnements, crampes, diarrhée
- Maux de tête / migraines (souvent le signe dominant)
- Flush (rougeur visage et cou)
- Urticaire, démangeaisons
- Rhinite, nez bouché
- Palpitations, hypotension
- Aggravation nette avec l'alcool
À éviter
- Fromages affinés : parmesan, roquefort, cheddar
- Charcuteries et viandes fermentées / fumées
- Poissons en conserve : thon, maquereau, anchois
- Vins, bières, champagne, alcool
- Tomate, épinard, avocat, aubergine
- Chocolat, cacao
- Sauces fermentées : soja, miso, kimchi
- Restes réchauffés (l'histamine augmente avec le temps)
Bien tolérés
- Viandes et poissons frais cuisinés et consommés immédiatement
- Légumes frais : brocoli, courgette, haricot vert, carotte
- Céréales non fermentées : riz, quinoa, avoine
- Produits laitiers frais : fromage blanc, lait, crème
- Huiles végétales, herbes fraîches
Comment tester : Dosage de l'activité DAO sanguine. Régime pauvre en histamine 4 semaines + journal des symptômes. Test de supplémentation DAO.
Intolérance souvent dose-dépendante et variable selon le cycle hormonal, l'état intestinal et les médicaments.
07
Déficit en sucrase-isomaltase (CSID/DSI)
Mécanisme : Mutation du gène SI → déficit enzymatique → saccharose et amidon ramifié non digérés → fermentation colique acide.
Symptômes
- Diarrhée acide et explosive après sucre ou amidon
- Ballonnements importants
- Crampes post-prandiales
- Chez l'enfant : diarrhée dès diversification alimentaire
- Souvent diagnostiqué comme SII pendant des années
À éviter
- Sucre sous toutes ses formes : blanc, roux, miel
- Confiseries, chocolat sucré, pâtisseries
- Sodas, jus de fruits sucrés
- Amidon : pain, pâtes, riz blanc, pomme de terre
- Fruits très sucrés : banane, mangue, raisin
Bien tolérés
- Viandes, poissons, œufs, fromages
- Légumes frais (la plupart)
- Riz refroidi (amidon rétrogradé mieux toléré)
- Légumineuses (amidon résistant)
- Glucose pur (dextrose) comme substitut
Comment tester : Biopsie duodénale avec dosage enzymatique (gold standard), test respiratoire au saccharose, ou analyse génétique du gène SI. Le variant p.V15F est notamment associé à des symptômes identiques à la DSI congénitale.
Maladie génétique rare mais sous-diagnostiquée. Traitement enzymatique disponible : sacrosidase (Sucraid). À évoquer si SII résistant avec aggravation après sucre et amidon.
08
Sensibilité au gluten non cœliaque (SGNC)
Mécanisme : Mécanisme mal élucidé (immunologique + perméabilité intestinale), distinct de la maladie cœliaque. Souvent partiellement lié aux fructanes du blé.
Symptômes
- Douleurs abdominales, ballonnements
- Diarrhée ou constipation
- Fatigue, brouillard mental
- Céphalées, douleurs articulaires
- Eczéma, dermatite
- Amélioration nette sous régime sans gluten
À éviter
- Blé, seigle, orge et tous leurs dérivés
- Pain, pâtes, pizza, biscuits, viennoiseries
- Boulghour, kamut, épeautre
- Bière (malt d'orge)
Bien tolérés
- Riz, maïs, quinoa, sarrasin, millet
- Pomme de terre, patate douce, légumineuses
- Farines certifiées sans gluten
- Avoine certifiée sans gluten (si tolérée)
Comment tester : OBLIGATOIRE : Éliminer d'abord la maladie cœliaque (sérologie + biopsie AVANT toute éviction). Si négatif + pas d'allergie au blé → tester les fructanes seuls d'abord.
~30% des personnes se croyant SGNC réagissent en réalité aux fructanes du blé et non au gluten. La maladie cœliaque doit toujours être exclue en premier.
09
SIBO : Prolifération bactérienne de l'intestin grêle
Mécanisme : Surpopulation anormale de bactéries dans l'intestin grêle → fermentation précoce des glucides → production d'H2 et/ou méthane → inflammation et malabsorption.
Symptômes
- Ballonnements précoces (dès 30–60 min après repas)
- Gaz importants
- Diarrhée (SIBO H2) ou constipation (SIBO méthane/IMO)
- Douleurs abdominales hautes
- Déficit en B12, fer, vitamines liposolubles
- Fatigue, perte de poids dans les formes sévères
À éviter
- Tous les glucides fermentescibles (FODMAPs)
- Sucres simples en grande quantité
- Fibres prébiotiques (inuline, FOS)
- Alcool
Bien tolérés
- Protéines et matières grasses (peu fermentescibles)
- Régime élémentaire ou pauvre en FODMAPs pendant le traitement
- Petits repas fréquents et espacés
Comment tester : Test respiratoire H2/CH4 après charge de glucose ou lactulose (gold standard non invasif). Bilan sanguin : B12, fer, vitamines D et A.
Le SIBO est une cause organique de SII (présent dans 30–85% des SII selon études). Il se traite par antibiotiques (rifaximine) + correction des causes. Le régime seul ne suffit pas.
10
Intolérance aux salicylates
Mécanisme : Déficit en sulfotransférase ou excès d'apports → inhibition des COX → dérivation vers les leucotriènes → inflammation, symptômes pseudo-allergiques.
Symptômes
- Douleurs abdominales, diarrhée, reflux
- Urticaire, eczéma, prurit
- Rhinite chronique, sinusite
- Asthme ou difficultés respiratoires
- Migraines
À éviter
- Épices : cannelle, cumin, paprika, curcuma, curry
- Fruits : pomme, raisin, orange, fraise, framboise
- Légumes : tomate, épinard, courgette, brocoli, avocat
- Miel, vin, bière, thé, café
- Aspirine et AINS
Bien tolérés
- Viandes, poissons, œufs (non marinés)
- Chou, navet, panais, céleri, haricot vert bouilli
- Poire épluchée, banane, figue fraîche
- Riz, maïs, pomme de terre
Comment tester : Pas de test biologique standardisé. Régime strict d'éviction 4–6 semaines, puis réintroduction progressive.
Souvent associée à une intolérance aux amines et aux additifs (syndrome ASA). Fréquente chez les personnes hypersensibles aux AINS.
11
Intolérance aux amines biogènes
Mécanisme : Déficit en MAO ou DAO → accumulation de tyramine, phényléthylamine, putrescine → effets vasomoteurs et neurologiques.
Symptômes
- Migraines et céphalées vasculaires (symptôme clé)
- Flush, bouffées de chaleur
- Palpitations, tachycardie
- Nausées, douleurs abdominales
- Troubles du sommeil
À éviter
- Fromages affinés (tyramine élevée)
- Chocolat, cacao
- Vins, bières, champagne
- Charcuteries et saucisses fermentées
- Poissons fermentés ou en conserve
- Avocats et bananes très mûrs
- Restes alimentaires réchauffés
Bien tolérés
- Viandes et poissons frais cuisinés immédiatement
- Légumes frais (sauf tomate, épinard, avocat)
- Produits laitiers frais non fermentés
- Céréales, légumineuses
- Fruits frais peu mûrs
Comment tester : Journal alimentaire + migraine : noter les déclencheurs dans les 6–24h. Régime d'éviction des amines.
Les IMAO (antidépresseurs) augmentent fortement la sensibilité aux amines : interactions médicament-aliment potentiellement graves avec la tyramine.
12
Intolérance à la caféine
Mécanisme : Hypersensibilité des récepteurs ou métabolisme lent (polymorphisme CYP1A2) → stimulation excessive du péristaltisme.
Symptômes
- Diarrhée matinale (surtout après café à jeun)
- Crampes abdominales
- Reflux gastro-œsophagien
- Palpitations, anxiété, tremblements
- Insomnie
À éviter
- Café (toutes formes)
- Thé noir, vert, blanc, maté
- Boissons énergisantes
- Sodas cola
- Chocolat noir (théobromine)
Bien tolérés
- Tisanes : camomille, verveine, menthe, tilleul
- Café décaféiné (souvent bien toléré)
- Rooibos
- Eau, jus de légumes
Comment tester : Diagnostic clinique simple : éviction complète de caféine pendant 2 semaines et observation.
L'effet du café sur le transit est aussi mécanique (réflexe gastro-colique) et lié à l'acidité, pas seulement à la caféine.
13
Intolérance aux additifs alimentaires
Mécanisme : Réactions non IgE-médiées aux colorants, conservateurs, exhausteurs de goût → voies inflammatoires, dégranulation mastocytaire.
Symptômes
- Diarrhée et crampes abdominales
- Urticaire, eczéma
- Rhinite, asthme
- Maux de tête
- Réactions systémiques (sulfites)
À éviter
- Glutamate monosodique (E621)
- Sulfites (E220–228) : vin, bière, fruits secs
- Benzoates (E210–213) : boissons sucrées
- Colorants azoïques : tartrazine E102
- Nitrites (E249–250) : charcuteries
Bien tolérés
- Aliments bruts non transformés
- Produits biologiques
- Épices naturelles certifiées
- Préparations maison avec ingrédients simples
Comment tester : Régime d'élimination des additifs (aliments bruts uniquement) 4 semaines. Réintroduction un additif à la fois.
Très fréquemment associé à l'intolérance aux salicylates et aux amines (syndrome multi-hypersensibilité).
14
Approche FODMAP globale
Mécanisme : FODMAPs (Fermentable Oligosaccharides, Disaccharides, Monosaccharides And Polyols) : glucides à chaîne courte → fermentation rapide dans le côlon + effet osmotique.
Symptômes
- Ballonnements (signe clé)
- Douleurs abdominales
- Alternance diarrhée/constipation
- Flatulences
- Amélioration souvent spectaculaire sous régime
À éviter
- Fructanes : blé, seigle, ail, oignon
- GOS : légumineuses, soja
- Lactose : lait, fromages frais
- Fructose : pomme, miel
- Polyols : pomme, poire, champignons, bonbons « sans sucre »
Bien tolérés
- Viandes, poissons, œufs, fromages affinés
- Carotte, courgette, haricot vert, poivron
- Orange, kiwi, fraise, banane mûre
- Riz, quinoa, avoine, polenta
- Produits laitiers sans lactose
Comment tester : Protocole en 3 phases : (1) Éviction stricte 4–6 semaines, (2) Réintroduction progressive groupe par groupe, (3) Personnalisation long terme. À réaliser AVEC un diététicien certifié FODMAPs.
Efficace chez 70–75% des patients SII. Le régime ne doit pas être permanent : il modifie le microbiote. L'objectif est de trouver votre seuil de tolérance personnel.
Méthodologie
Protocole d'investigation pas à pas
Une démarche structurée, une hypothèse à la fois, pour identifier la cause réelle de vos symptômes.
1
Bilan médical préalable OBLIGATOIRE
- Maladie cœliaque : sérologie anti-transglutaminase IgA + IgA totaux + biopsie AVANT tout régime sans gluten
- MICI (Crohn, colite) : coloscopie, calprotectine fécale
- Allergies IgE : prick-tests, dosage IgE spécifiques
- Causes infectieuses : coproculture, parasitologie
- Test respiratoire H2 ciblé selon suspicion : lactose, fructose, SIBO
2
Régime d'éviction ciblé avec un diététicien
- Commencer par UN seul groupe selon le tableau d'orientation ci-dessus
- Durée minimale d'éviction : 4 semaines
- Tenir un journal alimentaire et symptomatique quotidien
- Si pas d'amélioration → passer au groupe suivant
- Si amélioration → passer à l'étape 3
3
Réintroduction progressive
- Réintroduire un aliment à la fois, 3 jours entre chaque réintroduction
- Observer les symptômes dans les 24–48h
- Identifier votre seuil de tolérance (pas forcément zéro)
- Répéter pour chaque groupe d'aliments évincé
4
Personnalisation et suivi long terme
- Construire votre liste personnelle d'aliments tolérés et déclencheurs
- Bilan nutritionnel à 3 et 6 mois (prévenir les carences)
- Réévaluer régulièrement : la tolérance peut évoluer
- Si plusieurs intolérances coexistent : prioriser par ordre d'impact
Outil pratique
Journal alimentaire
Remplissez ce tableau quotidiennement pendant les phases d'éviction et de réintroduction.
| Date / Repas | Aliments consommés | Symptômes (0–10) | Délai | Facteurs |
|---|---|---|---|---|
| Ex : 17/03 - Déjeuner | Riz + poulet + courgettes | Ballonnements : 2/10 | 1h | RAS |
| Ex : 17/03 - Dîner | Pâtes + sauce tomate + fromage | Ballonnements : 7/10, gaz | 45 min | Stress au travail |
Pour aller plus loin
Ressources utiles
Applications recommandées
- Monash University FODMAP app : référence mondiale, base de données aliments FODMAPs
- Fig App : scan de codes-barres, FODMAPs et intolérances
- My Symptoms Food Diary : journal symptômes détaillé
En cas de SII sévère résistant
- Bilan chez un gastro-entérologue spécialisé en motilité digestive
- Diététicien certifié FODMAPs (formation Monash University)
- Prise en charge psychologique : hypnose intestinale dirigée, TCC, cohérence cardiaque (efficacité prouvée dans le SII)
Questions fréquentes
FAQ troubles digestifs
L'identification passe par un bilan médical préalable (exclusion maladie cœliaque, MICI, allergies), puis un protocole d'éviction ciblé d'un seul groupe alimentaire à la fois pendant 4 semaines minimum, suivi d'une réintroduction progressive. Un diététicien spécialisé vous guide dans cette démarche structurée.
Le régime FODMAP est efficace chez 70 à 75% des patients SII, mais il ne couvre pas toutes les causes de troubles digestifs. L'intolérance à l'histamine, la déficience en sucrase-isomaltase (DSI), le SIBO ou l'intolérance aux salicylates nécessitent des approches différentes. C'est pourquoi un bilan complet est indispensable avant de conclure.
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